Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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