Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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CDH18Q13634 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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CDH18Q13634 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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CDH18Q13634 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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