Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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TCIRG1Q13488 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TCIRG1Q13488 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TCIRG1Q13488 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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TCIRG1Q13488 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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