Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms