Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms