Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RLFQ13129 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RLFQ13129 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RLFQ13129 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLFQ13129 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RLFQ13129 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RLFQ13129 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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