Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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IFT88Q13099 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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IFT88Q13099 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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IFT88Q13099 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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