Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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TRAF1Q13077 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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TRAF1Q13077 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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TRAF1Q13077 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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TRAF1Q13077 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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TRAF1Q13077 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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TRAF1Q13077 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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TRAF1Q13077 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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TRAF1Q13077 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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TRAF1Q13077 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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TRAF1Q13077 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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TRAF1Q13077 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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TRAF1Q13077 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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