Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CSTF3Q12996 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CSTF3Q12996 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CSTF3Q12996 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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