Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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