Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms