Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms