Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms