Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms