Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms