Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HBBP68871 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HBBP68871 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HBBP68871 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HBBP68871 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HBBP68871 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HBBP68871 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HBBP68871 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HBBP68871 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HBBP68871 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HBBP68871 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HBBP68871 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HBBP68871 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HBBP68871 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HBBP68871 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HBBP68871 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms