Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms