Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGDP52209 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PGDP52209 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms