Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms