Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RECQLP46063 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RECQLP46063 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RECQLP46063 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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