Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSOP43234 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSOP43234 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSOP43234 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSOP43234 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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