Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PBX2P40425 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PBX2P40425 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PBX2P40425 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PBX2P40425 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PBX2P40425 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PBX2P40425 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PBX2P40425 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBX2P40425 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBX2P40425 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBX2P40425 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBX2P40425 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBX2P40425 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBX2P40425 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBX2P40425 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBX2P40425 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBX2P40425 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBX2P40425 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBX2P40425 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBX2P40425 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBX2P40425 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms