Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms