Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms