Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTBRP36941 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTBRP36941 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTBRP36941 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTBRP36941 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTBRP36941 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms