Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms