Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms