Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR7P32248 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR7P32248 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms