Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD6P30203 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD6P30203 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD6P30203 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD6P30203 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD6P30203 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD6P30203 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD6P30203 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD6P30203 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD6P30203 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD6P30203 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD6P30203 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD6P30203 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD6P30203 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD6P30203 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms