Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCKSP29966 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms