Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms