Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
APCP25054 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
APCP25054 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
APCP25054 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
APCP25054 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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APCP25054 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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APCP25054 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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APCP25054 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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APCP25054 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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APCP25054 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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APCP25054 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
APCP25054 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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APCP25054 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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APCP25054 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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APCP25054 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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