Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms