Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHBP21912 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHBP21912 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHBP21912 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms