Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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