Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR1P18146 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms