Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms