Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms