Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFTRP13569 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFTRP13569 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFTRP13569 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFTRP13569 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CFTRP13569 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFTRP13569 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFTRP13569 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms