Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms