Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHGAP10645 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHGAP10645 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHGAP10645 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms