Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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