Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYBBP04839 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYBBP04839 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYBBP04839 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYBBP04839 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYBBP04839 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYBBP04839 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYBBP04839 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYBBP04839 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYBBP04839 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms