Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms