Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG7O95352 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG7O95352 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms