Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CCNDBP1O95273 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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