Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COBLO75128 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COBLO75128 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COBLO75128 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COBLO75128 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COBLO75128 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COBLO75128 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COBLO75128 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COBLO75128 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COBLO75128 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLO75128 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLO75128 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms