Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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