Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms