Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms